Varje bokstav i DNAt läses av i jakten på sällsynta sjukdomar
Tre nya mutationer i genen XYLT2 hittades efter att forskare vid Centrum för Molekylär Medicin läst av DNA sekvenser från tre patienter som lider av skelettsjukdomen spondyloockulärt syndrom. Proteinet som genen XYLT2 utgör ritningen för upprätthåller en stabil miljö i kroppens vävnader.
Forskargruppen inom Klinisk Genetik vid Centrum för Molekylär Medicin fokuserar huvudsakligen på att identifiera de gener som orsakar sällsynta sjukdomar. En nyckelstrategi är att samla patientmaterial från familjer för att identifiera genvarianter som följer den klassiska typen av nedärvning. Forskarna använder så kallad massiv parallell sekvenseringsteknik för att läsa av varje bokstav i DNA hos flera olika personer. Genom att jämföra DNA från patienter och deras föräldrar med friska individer kan forskarna sedan identifiera de genetiska förändringar som orsakar sjukdom.
Nyligen analyserade forskargruppen en familj från Turkiet. Patienten, en åttaårig flicka, var diagnostiserad med spondyloockulärt syndrom (SOS), en sällsynt sjukdom med fram till nyligen okänd genetisk grund. Patienter med SOS lider av benskörhet, ryggradskompression fraktur, grå starr, hörselnedsättning och utvecklingsstörning. Även om sjukdomen varit känd sedan 2001, dröjde det till 2015 innan man upptäckte den bakomliggande genetiska orsaken.
ꟷ I vår patient hittade vi en patogen (sjukdomsframkallande) mutation i genen XYLT2 som kodar för ett enzym involverad i syntesen av ett protein som heter proteoglykan. Proteoglykaner spelar en viktig roll i upprätthållandet av stabil miljö i många vävnader, t.ex. ben, brosk, hud och senor. Mutationer i XYLT2-genen försämrar dessa processer, säger , PhD, postdoktor vid Institutionen för Molekylär Medicin och kirurgi vid Karolinska Institutet och förstaförfattare till studien.
Forskarna letade sedan efter XYLT2-mutationer i en större skara patienter diagnosticerade med SOS sedan tidiga barnår. Man fann ytterligare tre patienter, två syskon från Pakistan och en patient från Irak.
ꟷ Sammanfattningsvis rapporterade vi tre nya mutationer i XYLT2 genen som varit okända tidigare. Olika typ och plats av mutation gör proteinet mer eller mindre aktivt. Det kan förklara varför vissa SOS-patienter får allvarligare symptom än andra, säger Fulya Taylan.
Studien som utfördes i ett internationellt samarbete med forskargrupper i Finland, Turkiet och Kanada publicerades tidigare i år i den vetenskapliga tidskriften Journal of Bone and Mineral Research.
Centrum för molekylär medicin
CMM L8:05
Karolinska Universitetssjukhuset
171 76 Stockholm
Taggar: